Trgovine aplikacija postale su ključne za instaliranje sigurnih aplikacija - odnosno onih bez virusa, zlonamjernog softvera i drugih štetnih elemenata - iako se zlonamjerne aplikacije ponekad mogu provući. Apple izvorno ograničava instaliranje aplikacija iz Mac App Storea na Mac računarima , opciju koju možemo modificirati kako bismo omogućili instaliranje aplikacija ovlaštenih programera izvan Mac App Storea ili kako bismo omogućili instaliranje bilo koje aplikacije bez obzira na njeno porijeklo - najmanje preporučena opcija u svim slučajevima.
Najnovija verzija Windowsa 10 koju je objavio Microsoft, verzija 15042, sada je dostupna korisnicima za instalaciju. Ova nova verzija donosi promjenu koju mnogi korisnici možda neće cijeniti , jer je Microsoft zakomplicirao proces instaliranja aplikacija izvan Windows Store-a, slično Gatekeeper-u na Mac računarima, kao što je gore objašnjeno. Čini se da kompanija sa sjedištem u Redmondu želi da se korisnici naviknu na korištenje Windows Store-a, sekundarne i gotovo zaboravljene trgovine za mnoge korisnike Windowsa 10.
Problem s kojim se često susrećemo kod Windows Store-a je taj što mnoge trenutno dostupne aplikacije, budući da su univerzalne, nude vrlo drugačiji interfejs od onog na koji su korisnici Windowsa navikli. Ovaj interfejs eliminira veliki broj opcija. Jasan primjer ovih ograničenja je VLC aplikacija, čija se verzija u Windows Store-u potpuno razlikuje od verzije dostupne putem web stranice programera.
Jasno je da Windows, pored promocije korištenja Windows trgovine , želi da se korisnici osjećaju zaštićenije prilikom instaliranja aplikacija, aplikacija koje, budući da su dostupne u Windows trgovini, nude nam garanciju da ne sadrže viruse, crve, zlonamjerni softver i druge računarske štetočine.